研究結果揭示什麼呢？1999年，生物學家馬爾科姆·戈登寫道：「生命看來有很多源頭，統一生命樹的底部看來有不止一條樹根。」有沒有證據表明，生物各大分支都源自同一主幹，就像達爾文所說的那樣呢？戈登說：「生物同祖的傳統說法，看來解釋不了現存的生物界是怎樣來的。它解釋不了大多數動物門的起源，所有動物門的起源就更不用說了。傳統說法很可能也不能解釋各門動物又怎樣演變出許多綱的動物來。」²⁹a

近年的研究結果一次又一次否定達爾文的生物同祖的說法。例如，2009年《新科學家》週刊（英語）有一篇文章引述了支持進化論的科學家埃里克·巴蒂斯特的話。他說：「我們根本沒有證據證實生命樹的說法。」³⁰同一篇文章也引述了進化生物學家邁克爾·羅斯的話。羅斯說：「生命樹正被安葬，這是我們都知道的，但要接受這件事——生物學整個基本觀念都要改變——卻不是那麼容易。」³¹b

舉個例，進化生物學家斯圖爾特·紐曼在2008年接受訪談時，就談到可能要創立一種新的進化學說，好解釋新物種突然出現的現象。他說：「達爾文的學說一直被用來解釋生物演化的整個過程，但我認為，在解釋大進化（生物軀體結構大變演化成另一類生物）方面，達爾文的學說將會被降級，變成芸芸學說之一，也許說不上是值得看重的說法。」³³

談到這些化石相距的時間，動物學家亨利·吉說：「由於化石之間年份相距極遠，我們實在不能斷言化石顯示生物之間存在親緣關係。」³⁴c

談到魚和兩棲動物的化石，生物學家馬爾科姆·戈登說，所找到的化石代表性不足，「不大可能反映那些年代這兩類生物的多樣性」。他又說：「我們無法知道化石顯示的生物彼此有沒有關係，跟後來出現的生物又有沒有關係。」³⁵d

支持進化論的古生物學家戴維·勞普說：「無論是在達爾文時代還是在今天，地質學家都發現：化石記錄是斷斷續續的，物種在生物史上都是突然出現的，出現後沒怎麼改變，然後突然消失。」³²