雅加達的內部分歧

弟兄們努力適應戰爭期間的種種艱辛，可是，他們即將面對一項嚴峻的考驗。日本當局下令所有外國人（包括印尼籍華人）要辦理身分證，但是身分證上印有向日本帝國效忠的誓言，許多弟兄不禁想：「我們應該照政府要求的辦理登記，在身分證上簽名，還是該拒絕呢？」

費利斯·陳解釋說：「雅加達的弟兄要求我們這些在蘇加武眉的弟兄姊妹，不可以在身分證上簽名。我們詢問當局是否能將身分證上的文字，由『宣誓效忠日軍，特此簽名』改成『不會阻礙日軍，特此簽名』。出乎意料的是，當局竟然同意了，我們就領取了身分證。雅加達的弟兄聽到這個消息後，便把我們視為叛道者，毅然與我們斷絕關係。」

可悲的是，原先堅持不簽名的弟兄，被逮捕後卻改變立場，聲明放棄信仰。當時，安德烈·伊萊亞斯和一位不願簽名的弟兄都被關在獄中。安德烈說：「為了幫助他有比較平衡合理的看法，我跟他解釋身分證登記這件事，後來他謙卑地向我道歉，說他很後悔跟我們斷絕來往。我們彼此鼓勵，共度了美好的時光。但令我傷心的是，因為監獄環境惡劣，他在拘捕期間不幸過世。」

1945年8月17日，印尼獨立運動的領袖宣布印尼獨立，脫離荷蘭的殖民統治。在長達四年的革命運動期間，四處暴動，導致七百多萬人流離失所，數以萬計的人更因此喪生。

這段時期，弟兄們持續挨家挨戶地傳道。約瑟芬·伊萊亞斯說：「愛國人士強迫我們呼喊他們的口號『默德卡』，這句話的意思是『自由』，可是我告訴他們，我們在政治活動上保持中立。」經歷了長期的殖民統治，荷蘭終於在1949年將政權移交給印尼聯邦共和國（現稱印尼共和國）。b