以聖經的例子而言，發動迫害的有時是宗教勢力（可3:6；徒24:1,27）、不明真相的人（創21:8,9；加4:29）、無知之輩（提前1:13）或失去理性的狂熱分子（路4:28,29；徒14:19；17:5）。然而，真正的幕後黑手卻往往是肉眼看不見的邪靈，他們比人強大得多，也殘暴得多。（弗6:11,12）

根據載於創世記3:14,15的第一個聖經預言，耶和華上帝預告「蛇」和「女人」必彼此為敵，他們的「苗裔」之間也彼此為敵。整本聖經可以作證，這個預言確實應驗了。耶穌直接指出蛇就是魔鬼撒但，並且對迫害他的人說：「你們是從你們的父魔鬼那裡來的」；換言之，他們就是蛇的「苗裔」。（約8:37-59）聖經表明，魔鬼發動的迫害仍會持續，一直到基督掌權以及其後的一段時期，因為啟示錄說，大龍（即魔鬼撒但）和他的天使被逐到地上後會迫害「女人」，就是「跟她苗裔的剩餘分子作戰，他們就是遵守上帝的誡命、給耶穌作見證的人」。（啟12:7-17）古往今來，撒但在地上利用的主要工具，就是有象徵意義的「野獸」（詳見獸［有象徵意義的］；啟13:1,7），以及「大巴比倫」（詳見大巴比倫；啟17:5,6）。在聖經提到的不同時期，撒但一直利用這兩個工具去攻擊力行正義、遵守上帝旨意的人，與他們為敵。且看看歷史怎樣說明這一點。

歸根結底，宗教迫害的始作俑者往往是鼓吹錯誤宗教的惡勢力。耶利米就曾受當日的宗教領袖迫害。（耶26:11）使徒保羅的情形也一樣。（徒13:6-8；19:23-29）耶穌也不例外，聖經說：「祭司長和法利賽派召開公議會……該亞法……是當年的大祭司，對他們說：『你們什麼都不懂，也不想想，一個人替眾人死，免得全族滅亡，對你們有好處。』……於是從那一天起，他們就商議要殺耶穌。」（約11:47-53）肆意迫害耶穌、把他釘在苦刑柱上的人，都是跟存心謀害耶穌的宗教領袖同夥的。（太26:67；27:1,2,26-31,38-44）