當時法利賽派和撒都該派很有權勢，能左右輿論，甚至煽動群眾不接納耶穌是彌賽亞。（馬太福音15:1,2；16:1；約翰福音11:47,48；12:42,43）他們雖然很有影響力，《希伯來語經卷》卻從沒有提過這兩群人。

約瑟夫斯敘述公元前2世紀的歷史，首次提到撒都該派和法利賽派。

約瑟夫斯敘述海爾卡努斯的執政時期，首次指出法利賽派和撒都該派的影響力越來越大。（約瑟夫斯曾經提過約拿單在位期間的法利賽派。）他並沒有交代法利賽派的起源。有些學者認為，他們是從哈西德派分化出來的。哈西德是個虔誠宗派，曾支持猶大·馬加比為信仰而戰。後來猶大對政治有野心，哈西德派就跟他分道揚鑣。