Jen asi šest měsíců po tom, co Ježíš zahájil svou pozemskou službu, Nikodém uzná, že Ježíš „přišel jako učitel od Boha“. Zázraky, které Ježíš krátce předtím, v době Pasachu roku 30 n. l., vykonal v Jeruzalémě, zapůsobily na Nikodéma tak silně, že tento muž za Ježíšem jednou v noci přichází, vyznává, že v něj věří, a chce se o tomto učiteli dozvědět víc.

Jan 3:1–

Má také hluboké pochopení, což je vidět z toho, že uznává Ježíše jako učitele, kterého poslal Bůh. Nikodém se zajímá o duchovní věci a je neobyčejně pokorný. Pro člena židovského nejvyššího soudu jistě není snadné uznat, že syn obyčejného tesaře je mužem, kterého poslal Bůh!

Jan především poukázal na to, že tento židovský vladař „přišel [k Ježíšovi] v noci“. (Jan 3:2) Jeden znalec Bible o tom říká: „To, že Nikodém přišel v noci, nebylo ze strachu, ale proto, aby se vyhnul zástupům, které by ho při rozmluvě s Ježíšem vyrušovaly.“ Jan však o Nikodémovi říká, že to byl ten „člověk, který k [Ježíšovi] poprvé přišel v noci“. V témž kontextu pojednává o Josefovi z Arimatie, o němž říká, že „byl Ježíšovým učedníkem, ale tajným ze strachu před Židy“. (Jan 19:38, 39) Je tedy pravděpodobné, že důvodem, proč Nikodém navštívil Ježíše za tmy, byl ‚strach před Židy‘. Podobně se tehdy i jiní lidé báli mít s Ježíšem něco společného. (Jan 7:13)