O nadvládu nad Albánií po staletí bojovaly různé mocnosti, což s sebou přinášelo i náboženské konflikty. Počátkem 16. století bylo toto území nábožensky rozdělené, protože někteří lidé se hlásili k islámu a jiní k pravoslavné nebo katolické církvi.

Později vláda prakticky vymýtila organizované náboženství. Po druhé světové válce totiž komunistická strana veškeré náboženství zrušila a Albánii prohlásila za první ateistický stát na světě.