Nicht lange nachdem Hitler in Österreich einmarschiert war, gab die Regierung einen Erlaß heraus, wonach all die, die bereits während des Ersten Weltkrieges Militärdienst geleistet hatten, zu einer dreitägigen Waffenübung einberufen werden sollten. Demzufolge mußte sich Johann Rainer in den Kasernen in Innsbruck melden.

Welch ein Anblick! Achthundert Mann standen stramm, um den militärischen Eid zu leisten. Und vor allen verweigerte Bruder Rainer, dies zu tun. Ohne viel Aufheben wurde er zum Verhör in einen Raum gebracht. Als er den Raum verließ, sah er den Kaplan Klotz in Militäruniform, ein großes Kreuz um den Hals und viele Medaillen an der Brust, die ihm während des Ersten Weltkrieges verliehen wurden. Mit dem Gruß „Heil Hitler!“ ging der Priester auf den Offizier zu, um seine Meinung über Bruder Rainer zu äußern.

Einige Zeit später wurde Bruder Rainer wieder vor mehrere Offiziere gebracht, um verhört zu werden. Einer der Offiziere erwähnte, daß das, was der Priester ihnen erklärt habe, nicht mit dem übereinstimme, was Bruder Rainer gesagt habe. Bruder Rainer erwiderte, daß sie in Matthäus, Kapitel 23 nachlesen könnten, was Jesus über solche religiösen Führer sagte, nämlich, daß sie Heuchler seien. Ein anderer Offizier rief daraufhin aus: „Dieser Mann hat recht.“ Bruder Rainer wurde eingesperrt, und sein Fall wurde dem Landesgericht übertragen. Jetzt aber setzte sich die Besitzerin des Großhandelsgeschäftes, in dem er beschäftigt war, mit dem Polizeichef in Verbindung und behauptete, daß sie sonst niemanden hätte, der die Arbeit von Bruder Rainer tun könnte. Es wurde ihm somit erlaubt, zu seiner Familie und an seinen Arbeitsplatz zurückzukehren.

Johann Rainer weigerte sich, einen militärischen Eid abzulegen;