Au N. de Khartoum, le fleuve forme le Nil proprement dit et, en tant que tel, il ne reçoit les eaux que d’un seul tributaire de plus, l’Atbara ; le Nil et l’Atbara confluent à quelque 300 km au N.-E. de Khartoum.

L’Atbara vient aussi grossir les eaux du Nil.