ハルツームから北は本来のナイル川となり，そうなってからこの川に流れ込む支流はもう一つ，アトバラ川しかありません。アトバラ川はハルツームの北東約300㌔の所でナイル川と合流しています。

アトバラ川の増水した流れも加わってナイルの水かさは膨れ上がります。