Zarówno bogata roślinność, jak i niedostępność tego rejonu czyniły z En-Gedi idealną kryjówkę dla Dawida w okresie, gdy ścigał go król Saul. Dlatego w Biblii wspomniano o „trudno dostępnych miejscach w En-Gedi” (1Sm 23:29). Dzisiejsi turyści tak samo się wypowiadają o niebezpiecznych i urwistych przełęczach skalnych w tej okolicy.

W skałach wokół En-Gedi znajduje się mnóstwo przestronnych jaskiń. Być może w jednej z nich ukrył się Dawid ze swymi ludźmi (1Sm 24:3). Niejeden sugeruje, że „kamienne owczarnie”, przy których zatrzymał się Saul, to właśnie takie jaskinie, ale z dobudowanym u wejścia murem, zapewniającym schronienie przed niepogodą (1Sm 24:2-10).